Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 RSPH10B2-201ENST00000297186 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 RSPH10B-201ENST00000337579 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 SND1-201ENST00000354725 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 SIGLEC8-201ENST00000321424 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 ARHGAP36-203ENST00000370922 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 BLZF1-201ENST00000329281 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
A4D1N5 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 SCNM1-202ENST00000368905 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 UHRF1-206ENST00000622802 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
A4D1N5 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms