Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
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