Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms