Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSER1Q9C0I3 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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