Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms