Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 NAV2-204ENST00000396087 7882 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 MAST4-202ENST00000403625 10711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms