Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRRTQ9BXP5 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms