Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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C9orf16Q9BUW7 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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C9orf16Q9BUW7 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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C9orf16Q9BUW7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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C9orf16Q9BUW7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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C9orf16Q9BUW7 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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C9orf16Q9BUW7 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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