Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms