Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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NIPSNAP1Q9BPW8 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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NIPSNAP1Q9BPW8 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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NIPSNAP1Q9BPW8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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NIPSNAP1Q9BPW8 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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NIPSNAP1Q9BPW8 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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NIPSNAP1Q9BPW8 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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NIPSNAP1Q9BPW8 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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NIPSNAP1Q9BPW8 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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NIPSNAP1Q9BPW8 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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