Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms