Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms