Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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