Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA6Q92908 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms