Protein–RNA interactions for Protein: Q92618

ZNF516, Zinc finger protein 516, humanhuman

Predictions only

Length 1,163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF516Q92618 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF516Q92618 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms