Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms