Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 312.5 ms