Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASC4Q6P4E1 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASC4Q6P4E1 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASC4Q6P4E1 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASC4Q6P4E1 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASC4Q6P4E1 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASC4Q6P4E1 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASC4Q6P4E1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASC4Q6P4E1 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CASC4Q6P4E1 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASC4Q6P4E1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASC4Q6P4E1 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASC4Q6P4E1 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASC4Q6P4E1 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASC4Q6P4E1 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASC4Q6P4E1 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASC4Q6P4E1 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASC4Q6P4E1 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASC4Q6P4E1 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASC4Q6P4E1 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASC4Q6P4E1 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASC4Q6P4E1 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASC4Q6P4E1 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASC4Q6P4E1 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASC4Q6P4E1 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASC4Q6P4E1 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms