Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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RTL8BQ17RB0 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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RTL8BQ17RB0 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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RTL8BQ17RB0 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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RTL8BQ17RB0 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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RTL8BQ17RB0 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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RTL8BQ17RB0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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RTL8BQ17RB0 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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RTL8BQ17RB0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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RTL8BQ17RB0 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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