Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IMPG1Q17R60 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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