Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HADHQ16836 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HADHQ16836 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HADHQ16836 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HADHQ16836 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HADHQ16836 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HADHQ16836 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HADHQ16836 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HADHQ16836 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HADHQ16836 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HADHQ16836 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HADHQ16836 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HADHQ16836 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HADHQ16836 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HADHQ16836 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HADHQ16836 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HADHQ16836 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HADHQ16836 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms