Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B3Q16720 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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