Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A3Q16572 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms