Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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ZNF56Q15929 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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ZNF56Q15929 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
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ZNF56Q15929 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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