Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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