Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms