Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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LAPTM4AQ15012 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AL096869.2-202ENST00000557007 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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