Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GAPVD1Q14C86 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAPVD1Q14C86 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAPVD1Q14C86 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAPVD1Q14C86 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAPVD1Q14C86 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAPVD1Q14C86 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAPVD1Q14C86 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAPVD1Q14C86 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAPVD1Q14C86 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAPVD1Q14C86 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAPVD1Q14C86 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAPVD1Q14C86 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAPVD1Q14C86 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAPVD1Q14C86 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAPVD1Q14C86 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAPVD1Q14C86 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAPVD1Q14C86 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAPVD1Q14C86 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAPVD1Q14C86 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAPVD1Q14C86 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GAPVD1Q14C86 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GAPVD1Q14C86 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GAPVD1Q14C86 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GAPVD1Q14C86 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GAPVD1Q14C86 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GAPVD1Q14C86 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GAPVD1Q14C86 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GAPVD1Q14C86 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GAPVD1Q14C86 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GAPVD1Q14C86 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GAPVD1Q14C86 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GAPVD1Q14C86 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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