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| SEMA3A | Q14563 | KCNT1-211 | ENST00000491806 | 3678 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 14.89 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | EML4-201 | ENST00000318522 | 5549 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 14.89 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | BARHL2-201 | ENST00000370445 | 1979 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.89 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | OSBPL5-202 | ENST00000348039 | 2798 nt | TSL 2 BASIC | 14.89 | □□□□□ -0.03 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | ZSCAN30-208 | ENST00000592278 | 731 nt | TSL 4 BASIC | 14.88 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | FAM66A-202 | ENST00000602658 | 546 nt | TSL 5 BASIC | 14.88 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC244517.11-204 | ENST00000624424 | 760 nt | TSL 5 BASIC | 14.88 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | WHRN-202 | ENST00000362057 | 3566 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.88 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | XRCC3-211 | ENST00000555055 | 2584 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.88 | □□□□□ -0.03 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | AC006262.1-203 | ENST00000598170 | 1634 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.88 | □□□□□ -0.03 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | KDM5C-205 | ENST00000404049 | 5677 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 14.88 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PRKD2-206 | ENST00000595515 | 3012 nt | TSL 2 BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | DNAJB1-201 | ENST00000254322 | 2264 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | ATG5-201 | ENST00000343245 | 3092 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TMCO3-202 | ENST00000434316 | 3050 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ITGB4-206 | ENST00000579662 | 5554 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | GGT1-201 | ENST00000248923 | 2326 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | HTR7-202 | ENST00000336152 | 3126 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | VARS2-201 | ENST00000321897 | 4073 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | C1orf43-206 | ENST00000368521 | 1708 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TRMT11-201 | ENST00000334379 | 1565 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RHD-202 | ENST00000342055 | 1557 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PRKD2-202 | ENST00000433867 | 3321 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ATP6AP2-211 | ENST00000636196 | 1403 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | UBXN1-201 | ENST00000294119 | 1291 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | UBXN1-202 | ENST00000301935 | 1153 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC092933.1-201 | ENST00000393644 | 945 nt | BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | BLCAP-202 | ENST00000397131 | 633 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | BLCAP-203 | ENST00000397134 | 566 nt | APPRIS P1 TSL 4 BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL513303.2-201 | ENST00000413339 | 536 nt | TSL 2 BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PNKD-204 | ENST00000436005 | 978 nt | TSL 5 BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL590640.2-201 | ENST00000457038 | 527 nt | BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | IL32-218 | ENST00000530890 | 774 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TMEM170A-203 | ENST00000566980 | 547 nt | TSL 5 BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC012645.3-203 | ENST00000567153 | 520 nt | TSL 2 BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC007611.1-201 | ENST00000568150 | 826 nt | TSL 2 BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC025279.2-201 | ENST00000569730 | 653 nt | BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC005597.1-201 | ENST00000588092 | 420 nt | TSL 3 BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | EGLN2-209 | ENST00000594140 | 991 nt | TSL 2 BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SPATA21-206 | ENST00000612240 | 603 nt | TSL 5 BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC244669.2-201 | ENST00000612320 | 853 nt | BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ETV2-208 | ENST00000621247 | 941 nt | TSL 5 BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL160035.1-201 | ENST00000637583 | 576 nt | TSL 4 BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | HS2ST1-201 | ENST00000370550 | 6736 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC117489.1-201 | ENST00000625169 | 3217 nt | BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MICB-201 | ENST00000252229 | 2446 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |