Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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