Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms