Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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CUL1Q13616 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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CUL1Q13616 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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