Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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PEX6Q13608 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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PEX6Q13608 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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