Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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TRAF2Q12933 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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