Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 MMAB-205ENST00000537496 1188 ntTSL 214.97□□□□□ -0.011e-6■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 SF1-210ENST00000443908 767 ntTSL 312.88□□□□□ -0.351e-6■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 PSMC5-208ENST00000580265 646 ntTSL 412.66□□□□□ -0.381e-6■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 SF1-206ENST00000413725 843 ntTSL 212.26□□□□□ -0.451e-6■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 ANKRD10-210ENST00000494859 705 ntTSL 526.38■■□□□ 1.812e-38■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.881e-19■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 LAMP1-203ENST00000472564 5242 ntTSL 218.98■□□□□ 0.631e-19■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 SLC2A9-206ENST00000505104 1659 ntTSL 1 (best)16.89■□□□□ 0.291e-19■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.22e-38■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.191e-19■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.131e-19■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 ANKRD10-206ENST00000465753 997 ntTSL 1 (best)15.49■□□□□ 0.072e-38■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 SLC2A9-208ENST00000506583 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.281e-19■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 LAMP1-202ENST00000471046 424 ntTSL 310.98□□□□□ -0.651e-19■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 SLC2A9-209ENST00000506839 446 ntTSL 310.92□□□□□ -0.661e-19■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 SLC2A9-207ENST00000505506 567 ntTSL 210.68□□□□□ -0.71e-19■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 SLC2A9-213ENST00000513129 738 ntTSL 39.47□□□□□ -0.891e-19■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 ANKRD10-207ENST00000475809 446 ntTSL 23.55□□□□□ -1.842e-38■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 OAZ1-204ENST00000588673 780 ntTSL 318.4■□□□□ 0.541e-7■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 OAZ1-209ENST00000592787 857 ntTSL 215.36■□□□□ 0.051e-7■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 OAZ1-205ENST00000589361 679 ntTSL 1 (best)14.64□□□□□ -0.071e-7■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 MMS19-214ENST00000477575 986 ntTSL 29.62□□□□□ -0.874e-6■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 FASN-210ENST00000636968 100 ntTSL 514.83□□□□□ -0.047e-16■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 FASN-207ENST00000635197 627 ntTSL 313.61□□□□□ -0.237e-16■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 FASN-211ENST00000637026 100 ntTSL 57.6□□□□□ -1.197e-16■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 SCML1-205ENST00000419185 817 ntTSL 314.72□□□□□ -0.051e-7■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 SCML1-204ENST00000398080 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21e-7■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 SCML1-201ENST00000380041 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.281e-7■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 SCML1-202ENST00000380043 2830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.621e-7■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 SCML1-203ENST00000380045 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.041e-7■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 SCML1-206ENST00000427362 846 ntTSL 57.66□□□□□ -1.181e-7■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 SCML1-207ENST00000487842 4615 ntTSL 1 (best)6.1□□□□□ -1.431e-7■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.423e-7■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.723e-7■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 UXS1-206ENST00000441952 570 ntTSL 216.32■□□□□ 0.23e-7■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 UXS1-207ENST00000444193 800 ntTSL 310.49□□□□□ -0.733e-7■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 UXS1-202ENST00000409032 1935 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.743e-7■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 UXS1-204ENST00000416298 701 ntTSL 59.01□□□□□ -0.973e-7■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 A2M-209ENST00000539638 590 ntTSL 44.21□□□□□ -1.742e-9■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 ATIC-211ENST00000467388 714 ntTSL 24.41□□□□□ -1.72e-15■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 ATIC-209ENST00000446622 615 ntTSL 34.35□□□□□ -1.712e-15■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 POLR3E-207ENST00000563766 2061 ntTSL 221.19■□□□□ 0.984e-7■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 ACAP3-210ENST00000478065 2393 ntTSL 320.99■□□□□ 0.953e-15■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 POLR3E-204ENST00000561494 575 ntTSL 319.47■□□□□ 0.714e-7■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 POLR3E-205ENST00000563024 473 ntTSL 417.45■□□□□ 0.384e-7■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 POLR3E-214ENST00000565358 565 ntTSL 417.27■□□□□ 0.364e-7■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 POLR3E-212ENST00000564883 560 ntTSL 415.34■□□□□ 0.054e-7■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 TELO2-208ENST00000569744 575 ntTSL 515.11■□□□□ 0.013e-15■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 ACAP3-211ENST00000479108 485 ntTSL 313.68□□□□□ -0.223e-15■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 SRRT-219ENST00000641476 992 nt12.64□□□□□ -0.395e-8■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 EEF1D-219ENST00000527741 3718 ntTSL 212.61□□□□□ -0.394e-6■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 SRRT-201ENST00000423692 727 ntTSL 512.56□□□□□ -0.45e-8■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 POLR3E-216ENST00000567022 584 ntTSL 211.79□□□□□ -0.524e-7■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 ACAP3-205ENST00000438966 265 ntTSL 35.65□□□□□ -1.53e-15■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 MVD-211ENST00000565720 436 ntTSL 314.68□□□□□ -0.068e-13■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 C20orf204-201ENST00000358393 1466 ntTSL 224.57■■□□□ 1.524e-14■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 C20orf204-204ENST00000463337 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)21■□□□□ 0.954e-14■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 RBM12-204ENST00000424458 1068 ntTSL 222.84■■□□□ 1.256e-8■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.376e-8■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.276e-8■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 RBM12-206ENST00000435161 565 ntTSL 411.52□□□□□ -0.576e-8■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 RBM12-205ENST00000431148 583 ntTSL 410.68□□□□□ -0.76e-8■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.746e-8■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 ERBB3-214ENST00000550070 2729 ntTSL 1 (best)11.09□□□□□ -0.631e-6■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 LUC7L-218ENST00000494366 668 ntTSL 317.29■□□□□ 0.361e-6■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 LUC7L-206ENST00000419516 1211 ntTSL 513□□□□□ -0.331e-6■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 LUC7L-205ENST00000418978 989 ntTSL 511.63□□□□□ -0.551e-6■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 LUC7L-210ENST00000430864 695 ntTSL 511.37□□□□□ -0.591e-6■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 LUC7L-208ENST00000428363 498 ntTSL 511□□□□□ -0.651e-6■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 WDR59-217ENST00000569229 901 ntTSL 59.57□□□□□ -0.883e-26■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 SHMT2-233ENST00000557529 1369 ntTSL 212.41□□□□□ -0.427e-8■■□□□ 11.4
SF3A3Q12874 RBM3-204ENST00000466764 1375 ntTSL 315.53■□□□□ 0.085e-6■□□□□ 11.3
SF3A3Q12874 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.095e-6■□□□□ 11.3
SF3A3Q12874 RBM3-201ENST00000354480 1884 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.385e-6■□□□□ 11.3
SF3A3Q12874 RBM3-208ENST00000489344 724 ntTSL 212.38□□□□□ -0.435e-6■□□□□ 11.3
SF3A3Q12874 RBM3-203ENST00000376759 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.435e-6■□□□□ 11.3
SF3A3Q12874 SAP30BP-212ENST00000580322 1558 ntTSL 522.62■■□□□ 1.213e-6■□□□□ 11.3
SF3A3Q12874 SAP30BP-217ENST00000582022 2409 ntTSL 1 (best)16.05■□□□□ 0.163e-6■□□□□ 11.3
SF3A3Q12874 SAP30BP-201ENST00000293208 1272 ntTSL 514.92□□□□□ -0.023e-6■□□□□ 11.3
SF3A3Q12874 SAP30BP-221ENST00000583536 1000 ntTSL 314.85□□□□□ -0.033e-6■□□□□ 11.3
SF3A3Q12874 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.073e-6■□□□□ 11.3
SF3A3Q12874 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.073e-6■□□□□ 11.3
SF3A3Q12874 SAP30BP-214ENST00000580601 2786 ntTSL 214.03□□□□□ -0.163e-6■□□□□ 11.3
SF3A3Q12874 SAP30BP-203ENST00000542343 1011 ntTSL 29.62□□□□□ -0.873e-6■□□□□ 11.3
SF3A3Q12874 AGFG2-203ENST00000430857 915 ntTSL 522.33■■□□□ 1.171e-7■□□□□ 11.3
SF3A3Q12874 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.961e-7■□□□□ 11.3
SF3A3Q12874 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.321e-7■□□□□ 11.3
SF3A3Q12874 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.721e-7■□□□□ 11.3
SF3A3Q12874 ZNF638-219ENST00000487638 4233 ntTSL 1 (best)1.93□□□□□ -2.11e-7■□□□□ 11.3
SF3A3Q12874 CYBA-205ENST00000565588 221 ntTSL 29.81□□□□□ -0.841e-7■□□□□ 11.3
SF3A3Q12874 EIF3G-207ENST00000589009 1522 ntTSL 214.58□□□□□ -0.083e-21■□□□□ 11.3
SF3A3Q12874 EIF3G-210ENST00000590158 1034 ntTSL 214.54□□□□□ -0.083e-21■□□□□ 11.3
SF3A3Q12874 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.283e-21■□□□□ 11.3
SF3A3Q12874 EIF3G-206ENST00000588709 828 ntTSL 512.51□□□□□ -0.413e-21■□□□□ 11.3
SF3A3Q12874 EIF3G-202ENST00000587146 709 ntTSL 511.29□□□□□ -0.63e-21■□□□□ 11.3
SF3A3Q12874 EIF3G-213ENST00000593054 453 ntTSL 59.48□□□□□ -0.893e-21■□□□□ 11.3
SF3A3Q12874 EIF3G-208ENST00000589454 873 ntTSL 58.6□□□□□ -1.033e-21■□□□□ 11.3
SF3A3Q12874 ADD1-208ENST00000503062 488 ntTSL 29.5□□□□□ -0.895e-7■□□□□ 11.3
SF3A3Q12874 ADD1-228ENST00000541843 406 ntTSL 35.46□□□□□ -1.545e-7■□□□□ 11.3
SF3A3Q12874 BRD2-213ENST00000495733 3404 ntTSL 216.84■□□□□ 0.291e-6■□□□□ 11.3
Retrieved 100 of 27,864 protein–RNA pairs in 179.9 ms