Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KIF5AQ12840 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF5AQ12840 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF5AQ12840 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF5AQ12840 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF5AQ12840 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF5AQ12840 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF5AQ12840 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF5AQ12840 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF5AQ12840 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF5AQ12840 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF5AQ12840 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF5AQ12840 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF5AQ12840 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF5AQ12840 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF5AQ12840 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF5AQ12840 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF5AQ12840 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF5AQ12840 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF5AQ12840 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF5AQ12840 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF5AQ12840 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF5AQ12840 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF5AQ12840 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF5AQ12840 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF5AQ12840 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF5AQ12840 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF5AQ12840 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms