Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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KCNMA1Q12791 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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KCNMA1Q12791 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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KCNMA1Q12791 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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KCNMA1Q12791 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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KCNMA1Q12791 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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KCNMA1Q12791 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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KCNMA1Q12791 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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KCNMA1Q12791 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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KCNMA1Q12791 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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KCNMA1Q12791 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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KCNMA1Q12791 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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KCNMA1Q12791 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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KCNMA1Q12791 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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