Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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SREBF2Q12772 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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SREBF2Q12772 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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