Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOX4Q06945 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms