Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms