Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms