Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPL23P62829 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPL23P62829 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPL23P62829 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPL23P62829 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPL23P62829 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPL23P62829 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPL23P62829 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RPL23P62829 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPL23P62829 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPL23P62829 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPL23P62829 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPL23P62829 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPL23P62829 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPL23P62829 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPL23P62829 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPL23P62829 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPL23P62829 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPL23P62829 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPL23P62829 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPL23P62829 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPL23P62829 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPL23P62829 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPL23P62829 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPL23P62829 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPL23P62829 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPL23P62829 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPL23P62829 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPL23P62829 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RPL23P62829 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPL23P62829 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPL23P62829 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPL23P62829 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPL23P62829 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPL23P62829 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RPL23P62829 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPL23P62829 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPL23P62829 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPL23P62829 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPL23P62829 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPL23P62829 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPL23P62829 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPL23P62829 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPL23P62829 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPL23P62829 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms