Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ACTBP60709 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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