Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms