Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHBDL3P58872 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms