Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CLDN17P56750 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN17P56750 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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