Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP5P45974 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP5P45974 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP5P45974 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP5P45974 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP5P45974 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP5P45974 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP5P45974 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP5P45974 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP5P45974 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP5P45974 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP5P45974 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP5P45974 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP5P45974 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP5P45974 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP5P45974 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP5P45974 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP5P45974 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP5P45974 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP5P45974 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP5P45974 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP5P45974 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
USP5P45974 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP5P45974 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
USP5P45974 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP5P45974 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP5P45974 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP5P45974 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
USP5P45974 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP5P45974 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP5P45974 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP5P45974 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms