Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms