Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP13P45452 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MMP13P45452 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MMP13P45452 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MMP13P45452 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MMP13P45452 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MMP13P45452 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MMP13P45452 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MMP13P45452 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP13P45452 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP13P45452 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP13P45452 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP13P45452 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP13P45452 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP13P45452 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP13P45452 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP13P45452 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP13P45452 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP13P45452 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP13P45452 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP13P45452 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP13P45452 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms