Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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HOXD12P35452 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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HOXD12P35452 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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HOXD12P35452 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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HOXD12P35452 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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HOXD12P35452 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HOXD12P35452 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HOXD12P35452 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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